Изменение микробиома дыхательных путей при тяжелой астме связано с нейтрофилами

Пациенты с астмой легкой и средней степени тяжести могут испытывать затруднения дыхания, ситуация усложняется для пациентов с тяжелой астмой, при которой симптомы могут быть опасными для жизни. В любом случае пациенты не могут участвовать в повседневной деятельности, если их болезнь не контролируется.

Поскольку не существует единого "золотого стандарта", клинический диагноз астмы основывается на признаках рецидивирующих респираторных симптомов, обратимости при лечении против астмы и переменной затруднённости дыхания. Демонстрация любой или всех трех из этих функций в клинических условиях является сложной задачей, поскольку характер заболевания неустойчив.

Команда ученых, сотрудничающих с Global Medical Franchise GSK (Брентфорд, Великобритания), использовала метагеномное профилирование мокроты, чтобы определить, существует ли связь между нейтрофильным воспалением и микробиомом дыхательных путей при тяжелой астме. Ранее никаких метагеномных анализов при тяжелой астме для понимания этой взаимосвязи не проводилось. Индуцированная мокрота была получена у четырех когорт в рамках исследовательской программы U-BIOPRED: (A) – 97 человек с тяжелой астмой, некурящие, (B) – 50 человек с тяжелой астмой, бывшие/нынешние курильщики, (C) – 25 человек с нетяжелой астмой, которая лечится стероидами, и (D) – 23 здоровых в качестве контрольной группы.

Образцы готовили для секвенирования с помощью набора Illumina Nextera и определяли количественно с помощью высокочувствительных анализов Quant-iT dsDNA. Библиотеки были объединены и запущены с протоколами секвенирования спаренных концов 100 пар оснований на платформе Illumina HiSeq 2500.

Ученые сообщили, что произошло снижение насыщенности и разнообразия между тяжелой астмой и двумя контрольными когортами. При анализе метагеномных профилей разнообразие альфа-таксонов обратно коррелирует с процентом нейтрофилов мокроты. Veillonellaceae, Prevotellaceae, Neisseriaceae, Streptococcaceae, Porphyromonadaceae и Micrococcaceae - все отрицательно коррелировали с процентом нейтрофилов. Moraxellaceae положительно коррелировали с процентом нейтрофилов. Команда сообщила, что 67 операционных таксономических единиц (ОТЕ) значительно коррелировали с процентом нейтрофилов, а 65 ОТЕ отрицательно коррелировали с процентом нейтрофилов. Два ОТЕ: моракселла катаралис (Moraxella catarrhalis) и гемофильная палочка (Haemophilus influenzae) положительно коррелировали. Тридцать генов были отрицательно связаны с процентом нейтрофилов. С эозинофилами мокроты корреляции обнаружено не было.

Авторы этого исследования связывают аномальный метагеномный профиль дыхательных путей при тяжелой астме с нейтрофильным воспалением дыхательных путей. Дальнейшее внимание необходимо для лучшего понимания динамики этих взаимоотношений, поскольку тяжелая нейтрофильная астма остается важной клинически неудовлетворенной потребностью. Исследование было представлено 22 мая 2019 года на ежегодном собрании Американского торакального общества (American Thoracic Society Annual Meeting), которое состоялось 17-22 мая 2019 года в Далласе, штат Техас, США.

Ссылки по теме:
Global Medical Franchise GSK