Анализ с помощью мультигенной панели выявляет варианты риска онкозаболеваний

Ежегодно более 608 000 пациентам ставится диагноз рака яичников, молочной железы, поджелудочной железы, простаты и колоректального рака. Текущие нормативы рекомендуют брать анализы у всех пациентов с раком яичников и поджелудочной железы, а также у пациентов с раком простаты, молочной железы и колоректальным раком (КРР), которые соответствуют определенным критериям.

Однако нормативы мало что говорят о роли расширенного мультигенного группового анализа у таких пациентов. Исследования стали показывать, что тестирование зародышевой линии с использованием комплексных мультигенных панелей выявляет клинически действующие мутации в генах, отличных от рекомендованных для данного типа рака у пациента, при очень скромных дополнительных затратах на выявление этих дополнительных мутаций.

Группа ученых, сотрудничающая с компанией по генетическому тестированию Invitae (Сан-Франциско, штат Калифорния, США), проанализировала данные неидентифицированных последовательностей для 83 генов риска развития рака у 81 861 пациента с раком молочной железы, 11 124 – с раком яичников, 9669 – с КРР, 5794 – с раком простаты и 4659 пациентов с раком поджелудочной железы, направленных на генетическое тестирование наследственного рака. Эти гены анализировались единым образом для всех пациентов в данном исследовании, независимо от конкретных генов, определенных клиницистами на основе личного/семейного анамнеза.

Команда сравнила положительный показатель для каждого типа рака, где положительное заключение определялось наличием вероятно патогенного (ВП) или патогенного (П) варианта. Положительные показатели для минимальной генной панели для соответствующего показания (например, BRCA1/2 или пяти генов синдрома Линча [СЛ]) были рассчитаны и сопоставлены с положительными показателями при анализе комплексной панели из 83 генов.

Когда была применена комплексная панель Invitae Multi-Cancer 83-gene, общий диагностический показатель для всех 113 107 пациентов с исследуемыми молочной железой, яичниками, поджелудочной железой, простатой и КРР увеличился почти в 4 раза, до 16%. Исключение моноаллельных вариантов П/ВП в преимущественно рецессивных генах риска рака (например, MUTYH) снижает результативность диагностики до 13%. При стратификации по типу рака и удалении моноаллельных рецессивов положительный результат был следующим: 11,8% случаев рака молочной железы, 18% – яичников, 15% – простаты, 16% – поджелудочной железы и 19% – КРР.

Авторы пришли к выводу и предположили, что нормативы генетического тестирования должны быть расширены, чтобы включить четкие рекомендации, поддерживающие мультигенное групповое тестирование на нескольких генах у пациентов с раком, для совершенствования ухода за пациентами и оказания помощи членам их семей. Роберт Нуссбаум (Robert Nussbaum), доктор медицины, главный медицинский директор Invitae, говорит: “Панели генетических тестов, которые включают всего лишь несколько из клинически важных генов, предоставляют неполную генетическую информацию для пациентов и их врачей, как с точки зрения выбора вариантов лечения, так и выявления дополнительных рисков для здоровья”. Исследование было представлено на ежегодном собрании Американской коллегии медицинской генетики и геномики (American College of Medical Genetics and Genomics), которое состоялось 2-6 апреля 2019 года в Сиэтле, штат Вашингтон, США.

Ссылки по теме:
Invitae