Проведена оценка респираторной панели на острые инфекции дыхательных путей

Инфекции верхних дыхательных путей - это болезни, вызванные острой инфекцией, которая затрагивает верхние дыхательные пути (нос, пазухи, глотка или гортань). Заболевание обычно сопровождается заложенностью носа, болью в горле, тонзиллитом, фарингитом, ларингитом, синуситом, отитом среднего уха и простудой.

Большинство инфекций – вирусные по своей природе, в иных случаях причины являются бактериальными. Вирусы не наносят ущерба клеткам верхних дыхательных путей, а скорее вызывают изменения в плотных контактах между эпителиальными клетками. Это позволяет вирусу получить доступ к тканям под эпителиальными клетками и инициировать врожденные и адаптивные иммунные ответы.

Ученые из Университетской больницы Гента (Ghent University Hospital; Гент, Бельгия) и их коллеги использовали коллекцию контрольных проб по качеству (Quality Control for Molecular Diagnostics - QCMD) и клинических образцов, ранее проанализированных с помощью проверенных рутинных методов. Коллекция из 111 образцов, 43 образцов QCMD, 13 образцов жидкости бронхоальвеолярного лаважа и 55 носоглоточных аспиратов/мазков были протестированы с помощью анализов респираторной панели Allplex (Allplex Respiratory Panel Assays).

Клинические образцы были протестированы ранее с использованием либо анализа количественной полимеразной цепной реакции (ПЦР) FTD Respiratory Pathogens 21, либо внутренней многолокусной ПЦР для панелей Bordetella, либо BioGX Sample-Ready Atypical Pneumonia. Образцы хранились при -80 °C перед анализом с помощью Seegene Allplex, нуклеиновые кислоты автоматически экстрагировались при помощи NucliSENS Easymag.

Исследователи сообщили, что анализ Seegene Allplex правильно идентифицировал 41/43 QCMD образца (95,4%); два образца, положительных на респираторно-синцитиальный вирус (РСВ) и человеческий метапневмовирус соответственно, были правильно идентифицированы только после контроля в динамике. В 56 клинических образцах было выявлено 97 патогенов: 65 патогенов (67,0%) были обнаружены как при помощи обычных методов, так и при помощи Seegene, 24 патогенов (24,7%) – только рутинными методами и 8 патогенов (8,2%) – только Seegene. Большинство несогласующихся результатов было обнаружено в образцах с низкой патогенной нагрузкой (22/32, 68,8%) и в образцах, содержащих множественные патогены (25/32, 78,1%). Было обнаружено полное согласие между методами в случае гриппа, РСВ, аденовируса, паракоклюшной палочки и хламидии пневмонии. Несогласие наблюдалось для метапневмовируса человека, коронавируса OC43, бокавируса и вируса парагриппа, главным образом типа 4.

Авторы пришли к выводу, что в целом анализ Seegene Allplex хорошо зарекомендовал себя для рутинного выявления важных респираторных мишеней. Допустимое согласие наблюдалось между Seegene и другими рутинными анализами. Исследование было опубликовано 11 октября 2018 года в журнале Acta Clinica Belgica.

Ссылки по теме:
Университетская больница Гента