LabMedica

Download Mobile App
Recent News Expo Clinical Chem. Molecular Diagnostics Hematology Immunology Microbiology Pathology Technology Industry Focus

Секвенирование нового поколения выявляет моногенный диабет

By LabMedica International staff writers
Posted on 03 Sep 2019
Print article
Система MiSeq: доступ к специализированным приложениям, таким как целевое ресеквенирование, метагеномика, секвенирование малого генома, целевое профилирование экспрессии генов (фото любезно предоставлено Illumina).
Система MiSeq: доступ к специализированным приложениям, таким как целевое ресеквенирование, метагеномика, секвенирование малого генома, целевое профилирование экспрессии генов (фото любезно предоставлено Illumina).
Моногенный диабет наблюдается главным образом в сахарном диабете взрослого типа у молодых (MODY) и составляет 1-2% всех случаев диабета. У взрослых моногенный диабет трудно отличить от случаев обычного диабета.

Диагностирование моногенного диабета является примером прецизионной медицины, поскольку в том случае передаются специфические особенности в отношении тяжести и течения гипергликемии, риска осложнений диабета, необходимости лечения диабета и его формы, наличия сопутствующих особенностей и лечения больных женщин во время беременности.

Медицинские генетики из больницы Пит-Сальпетриер (Париж, Франция) и их коллеги включили в перекрестное исследование 1564 обследуемых (пробандов), которые были набраны из 116 отделений эндокринологии по всей Франции. Критериями включения были отсутствие аутоантител к диабету и минимум два из трех следующих критериев: возраст ≤ 40 лет и индекс массы тела (ИМТ) <30 кг/кв.м при диагностике у пробанда или по крайней мере у двух родственников с диабетом и семейной историей диабета в 2 и более поколениях.

Генетическое тестирование проводилось в два этапа. Первым было целевое секвенирование нового поколения (СНП), основанное на анализе мультиплексной полимеразной цепной реакции, анализе SureMODY-MASTR. Кодирующие области ± 30 п.н.о. из семи генов (GCK, HNF1A, HNF4A, HNF1B, ABCC8, KCNJ11 и INS) и минимальная область промотора HNF1A, HNF4A и INS были амплифицированы, а мультиплексные библиотеки были впоследствии объединены и запущены на аппарате MiSeq.

Ученые сообщили, что патогенные варианты были выявлены у 254 пациентов (16,2%) и у 23,2% пациентов европеоидной расы. Использование более строгих критериев отбора (семейный анамнез диабета в 3 и более поколениях, возраст при диабете 40 лет и менее и ИМТ <30 кг/кв.м у пробандов, европейское происхождение) увеличило частоту диагностирования до 43%, но 70% идентифицированных случаев были пропущены. GCK (44%), HNF1A (33%) и HNF4A (10%) составляли большинство случаев. Варианты HNF1B (6%), ABCC8/KCNJ11 (4,4%) и INS (2,8%) составили 13% случаев.

По сравнению с немоногенными случаями, более молодой возраст, более низкий ИМТ и отсутствие симптомов диабета при постановке диагноза, европейское происхождение и семейный анамнез диабета в 3 и более поколениях были связаны с моногенным диабетом, но с широким совпадением фенотипов между двумя группами. В общей популяции были выявлены два кластера, которые в основном различались по степени тяжести диабета в начале заболевания. Моногенный диабет был более распространенным в более умеренном фенотипическом кластере. Фенотипы 59 пациентов (3,8%) с вариантами неопределенной значимости отличались от таковых у пациентов с патогенными вариантами, но не от немоногенных пациентов.

Авторы пришли к выводу, что варианты генов HNF1B и АТФ-зависимый калиевый канал чаще участвуют в моногенном диабете, чем сообщалось ранее. Наложение фенотипа затрудняет диагностику моногенного диабета у подростков/взрослых и лежит в основе преимуществ использования СНП у клинически отобранных пациентов. Исследование было опубликовано 11 июля 2019 года в журнале BMC Medicine.

Ссылки по теме:
Pitié-Salpêtrière Hospital

Platinum Member
COVID-19 Rapid Test
OSOM COVID-19 Antigen Rapid Test
Magnetic Bead Separation Modules
MAG and HEATMAG
Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Test
GPP-100 Anti-CCP Kit
Gold Member
ADAMTS-13 Protease Activity Test
ATS-13 Activity Assay

Print article

Channels

Clinical Chemistry

view channel
Image: The 3D printed miniature ionizer is a key component of a mass spectrometer (Photo courtesy of MIT)

3D Printed Point-Of-Care Mass Spectrometer Outperforms State-Of-The-Art Models

Mass spectrometry is a precise technique for identifying the chemical components of a sample and has significant potential for monitoring chronic illness health states, such as measuring hormone levels... Read more

Hematology

view channel
Image: The CAPILLARYS 3 DBS devices have received U.S. FDA 510(k) clearance (Photo courtesy of Sebia)

Next Generation Instrument Screens for Hemoglobin Disorders in Newborns

Hemoglobinopathies, the most widespread inherited conditions globally, affect about 7% of the population as carriers, with 2.7% of newborns being born with these conditions. The spectrum of clinical manifestations... Read more

Immunology

view channel
Image: The AI predictive model identifies the most potent cancer killing immune cells for use in immunotherapies (Photo courtesy of Shutterstock)

AI Predicts Tumor-Killing Cells with High Accuracy

Cellular immunotherapy involves extracting immune cells from a patient's tumor, potentially enhancing their cancer-fighting capabilities through engineering, and then expanding and reintroducing them into the body.... Read more

Microbiology

view channel
Image: The T-SPOT.TB test is now paired with the Auto-Pure 2400 liquid handling platform for accurate TB testing (Photo courtesy of Shutterstock)

Integrated Solution Ushers New Era of Automated Tuberculosis Testing

Tuberculosis (TB) is responsible for 1.3 million deaths every year, positioning it as one of the top killers globally due to a single infectious agent. In 2022, around 10.6 million people were diagnosed... Read more