Микроматричный анализ сигнатур экспрессии генов в образцах крови открывает биомаркер повышенного риска смерти по причине сердечно-сосудистой патологии

Среди группы пациентов, страдающих от ишемической болезни сердца (ИБС), были найдены различия в экспрессии гена, которые, казалось, демонстрировали признаки того, кто из них имел более высокий риск смерти от данного заболевания.

Исследователи из Технологического института штата Джорджия (Атланта, США) и коллеги из Университета Эмори (Атланта, штат Джорджия, США) и Принстонского университета (Принстон, штат Нью-Джерси, США) проверили, могут ли профили экспрессии генов, полученных из периферической крови, предсказать острый инфаркт миокарда и/или смерть по причине сердечно-сосудистой патологии.


Были проанализированы образцы крови 338 пациентов с ИБС (220 мужчин, 118 женщин) в возрасте от 51 до 73 лет и проконтролировано их состояние на предмет смерти по причине сердечно-сосудистой патологии в течение 2,4 лет. Экспрессия гена измерялась с использованием микроматриц HT-12, продукта компании Illumina (Сан-Диего, штат Калифорния, США).

Микроматрицы компании Illumina – HumanHT-12 v4 Expression BeadChip – обеспечивают транскрипционный охват по всему геному хорошо изученных генов, генов-кандидатов и сплайс-вариантов, позволяя реализовать процесс обработки с высокой пропускной способностью 12-ти образцов на один BeadChip без необходимости в дорогой, специализированной системе автоматического управления и контроля. Каждое испытание на матрице HumanHT-12 v4 Expression BeadChip охватывает более 47000 зондов, полученных из базы данных эталонных последовательностей Национального центра биотехнологической информации и других источников. Микроматрицы HumanHT-12 Expression BeadChips используют технологию прямой гибридизации и просматриваются на системах HiScan или iScan.

Результаты исследования показали, что отмечалась значительная разница в экспрессии гена между группами здоровых людей и людей с острым инфарктом миокарда с полным подавлением генов, связанных с передачей сигналов T-лимфоцита и активацией возбуждающих генов. На протяжении периода последующего наблюдения 31 пациент умер от ИБС. Генный анализ этих людей привел к ковариации 238 генов, которые были дифференцированно выражены между умершими и оставшимися в живых, и которые в значительной степени предсказали риск смерти вследствие сердечно-сосудистой патологии.

“Новым в этом исследовании является признание того, что существует путь риска и что он имеет отношение к особым аспектам функций иммунной системы, которые включают передачу сигналов T-лимфоцитов, — сказал старший автор, доктор Грегори Гибсон (Gregory Gibson), преподаватель биологии в Технологическом институте штата Джорджия. — Мы не ограничивались характерными признаками ишемической болезни сердца, чтобы действительно предвидеть отличительные черты неблагоприятного исхода у той части населения, которая составляет группу повышенного риска. Мы рассчитываем, что используя наш маркер, основанный на экспрессии гена, а также некоторые биохимические маркеры, информацию о генотипе и случаи заболевания в семье, мы сможем произвести многоуровневую оценку рисков неблагополучных коронарных приступов среди людей. Это сможет привести к индивидуальному медицинскому подходу к людям, выздоравливающим после сердечного приступа или аорто-коронарного шунтирования”.

“Мы мечтаем о портативном устройстве, которое позволит пациентам брать маленькую каплю крови, как в настоящее время делают диабетики, и получать анализ транскриптов, за которыми они могут следить в домашних условиях, — сказал доктор Грегори. — Если мы можем использовать такую информацию, чтобы помочь людям принять навыки здорового образа жизни, то это будет очень положительно”.

Исследование экспрессии гена ишемической болезни сердца (ИБС) было опубликовано 30 мая 2014 года, интернет-версия журнала Genome Medicine.

Ссылки по теме:
Georgia Institute of Technology
Emory University
Illumina