Молекулярная диагностика оптимизирована для образцов ткани рака молочной железы

Прогностический 70-генный профильный анализ для выявления ранней стадии рака молочной железы стал доступным для свежевзятой ткани, и улучшения в обработке рибонуклеиновой кислоты (РНК) сделали возможной микроматричную диагностику фиксированных в формалине и залитых парафином образцов ткани (ФФЗП).

Тест основан на точном измерении экспрессии генов путем анализа микроматрицы и был разработан и утвержден для свежей и свежезамороженной опухолевой ткани в целях гарантии высокого качества РНК для проведения анализа. Анализ экспрессии генов с использованием ФФЗП ткани уже долгое время является сложным из-за нестандартизированных протоколов фиксации и из-за ненадежной выборки высококачественной РНК из ФФЗП-материала за счет фрагментации РНК и перекрестного сшивания в результате фиксации в формалине.


Ученые из Туринского университета (Италия) и их коллеги из других организаций оптимизировали анализ на 157 образцах ФФЗП; анализ был создан с применением 125 соответствующих друг другу ФФЗП и образцов свежей ткани. Подтверждение результатов MammaPrint для ФФЗП-анализа (Agendia; Ирвин, штат Калифорния, США) сравнивалось с анализом свежих образцов MammaPrint и проводилось на независимой серии согласованных тканей для 211 образцов из пяти больниц.

Анализ MammaPrint с использованием ФФЗП анализируемого вещества продемонстрировал общую эквивалентность 91,5% между 211 независимыми соответствующими ФФЗП и свежими образцами опухолевых тканей. Точность составляла 97,3%, а повторяемость – 97,8% с высоко воспроизводимыми результатами между повторной выборкой образцов той же опухоли, а также между двумя лабораториями. Точность и воспроизводимость анализа ФФЗП оценивались по набору четырех диагностических образцов, которые были обработаны и проанализированы в двух экземплярах в течение 20 последующих дней. MammaPrint показал стабильные результаты на ФФЗП, с очень высокой относительной постоянностью для точности.

Авторы пришли к выводу, что тест MammaPrint может быть использован на ядре и хирургических срезах ФФЗП-ткани в качестве альтернативы свежей ткани. Анализ MammaPrint ФФЗП имеет превосходную воспроизводимость, точность и повторяемость, с производительностью, аналогичной тесту MammaPrint на свежей ткани. Исследование было опубликовано 28 декабря 2013 года в Journal of Molecular Diagnostics.

Ссылки по теме:
University of Turin
Agendia