We use cookies to understand how you use our site and to improve your experience. This includes personalizing content and advertising. To learn more, click here. By continuing to use our site, you accept our use of cookies. Cookie Policy.

LabMedica

Download Mobile App

Геномный анализ выявляет различия в подтипах рака печени

By Labmedica International staff writers
Posted on 20 Jun 2019
Внутрипеченочная холангиокарцинома (ВХК) является вторым наиболее распространенным злокачественным новообразованием, возникающим в печени. ВХК составляет около 10% всех холангиокарцином. Она возникает из периферических желчных протоков в паренхиме печени, близко расположенных к ответвлениям желчевыводящей системы второго порядка.

Комбинированная гепатоцеллюлярная холангиокарцинома (кГЦК-ХК) является редким типом первичного рака печени, объединяющим гистопатологические признаки как гепатоцеллюлярной карциномы (ГЦК), так и холангиокарциномы (ХК). Из-за редкости и неоднозначных диагностических критериев заболевание по-прежнему остается плохо изученным и не имеет четко обозначенных вариантов лечения рецидивирующего или метастатического заболевания.

На снимке: диаграмма геномного и транскриптомного профилирования комбинированной гепатоцеллюлярной и внутрипеченочной холангиокарциномы демонстрирует различные молекулярные подтипы (фото любезно предоставлено Пекинским университетом).
На снимке: диаграмма геномного и транскриптомного профилирования комбинированной гепатоцеллюлярной и внутрипеченочной холангиокарциномы демонстрирует различные молекулярные подтипы (фото любезно предоставлено Пекинским университетом).

Многочисленная группа ученых совместно с коллегами Пекинского университета (Пекин, Китай) секвенировала геномы и транскриптомы 133 случаев кГЦК-ВХК, включая относящиеся к отдельным, комбинированным и смешанным подтипам кГЦК-ВХК. В паназиатском многоцентровом исследовании они проанализировали образцы кГЦК-ВХК с использованием комбинации секвенирования всего экзома, всего генома, РНК и выявления однонуклеотидных вариантов. На основании установленных критериев удалось классифицировать 121 из этих кГЦК-ВХК-случаев как отдельные, комбинированные или смешанные подтипы кГЦК-ВХК.

Среди всех рассмотренных образцов наиболее значимо мутировавшими генами были TP53, AXIN1 и RB1, при этом сигнальные пути, вовлеченные в модификацию гистонов и метилирование ДНК, претерпевали изменения главным образом в случае кГЦК-ВХК. Кроме того, было отмечено изменение некодирующих и структурных областей, включая изменения, влияющие на промотор TERT и гибридные гены, а также на фокально амплифицированные и исключенные участки. Ученые также сравнили мутационный ландшафт этих кГЦК-ВХК-образцов с аналогичным, выявленным в ГЦК и ВХК, и обнаружили, что TP53 мутировал почти в половине случаев кГЦК-ВХК, что значительно выше, чем в одних только ГЦК- или ВХК-опухолях, в то время как случаи кГЦК-ВХК имели более низкие показатели мутаций CTNNB1, по сравнению с ГЦК, и более низкие показатели мутаций KRAS, по сравнению с ВХК.

Ученые предположили, что предыдущая полемика о том, является ли кГЦК-ВХК отдельным типом рака печени, может быть обусловлена ранее изданной работой, в которой выборочно исследовался только один из этих подтипов кГЦК-ВХК, в некоторой степени напоминавший ВХК или ГЦК. Исследователи отметили, что как смешанные, так и комбинированные кГЦК-ВХК связаны с характеристикой стволовых клеток и имеют плохой прогноз. Оба типа имеют высокую экспрессию нестина, маркера бипотентной овальной клетки-предшественника, которая может придать раковым клеткам высокую клеточную пластичность. Когда сравнивались уровни нестина в различных подтипах кГЦК-ВХК с ГЦК и ВХК, обнаружилось, что более 80% образцов кГЦК-ВХК имели более высокие уровни нестина, чем образцы с ГЦК или ВХК. Это говорит о том, что нестин может служить биомаркером для диагностики кГЦК-ВХК. Исследование было опубликовано 23 мая 2019 года в журнале Cancer Cell.

Ссылки по теме:
Peking University


Latest Молекулярная диагностика News