Генетический тест выявляет риск рака анального канала

Рак анального канала обычно является следствием поражения вирусом папилломы человека (ВПЧ), который является тем же вирусом, который вызывает рак шейки матки. Диагностика при этом крайне проблематична, поскольку полная биопсия болезненна, а получение небольшого количества клеток для цитологии вызывает трудности, потому что поражения могут быть скрыты.

Разработан новый генетический тест, который может стать точным и недорогим способом поиска и лечения лиц с самым высоким риском развития рака анального канала – болезни, все чаще встречающейся у женщин, мужчин, имеющих половые контакты с мужчинами (МСМ), и людей с вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ).

Ученые из Лондонского университета королевы Марии (Queen Mary University of London, Великобритания) и их коллеги получили набор анальных и перианальных образцов биопсии от 148 пациентов (116 мужчин, 31 женщины и одного человека с незарегистрированным полом), из которых 94 были ВИЧ-инфицированными, 40 были ВИЧ-отрицательными и 14 не были проверены на наличие у них ВИЧ. Большинство биопсий показало морфологические изменения, варьирующие от легкого до тяжелого состояния, что отличало их от окружающего нормального эпителия, не являющегося ацетобелым.

Для генотипирования ВПЧ команда использовала окрашенные гематоксилином и эозином срезы ткани, прошедшие обработку; образцы были протестированы с использованием комплекта PapType High Risk HPV Detection and Genotyping для определения высокого риска ВПЧ. Комплект способен обнаруживать 13 вариантов высокого риска ВПЧ, тип возможного высокого риска (HPV66) и два типа низкого риска (HPV6 и HPV11). Бисульфитные превращения ДНК-экстрактов осуществляли с использованием набора для метилирования ДНК EZ DNA Methylation Kit. Продукты полимеразной цепной реакции (ПЦР) подвергали пиросеквенированию с использованием аппарата PyroMarkQ96 ID.

Ученые установили, что наиболее распространенным типом ВПЧ был ВПЧ16, обнаруженный в 54% из 30 доброкачественных биопсий, 33% из 43 высокодифференцированных анальных интраэпителиальных неоплазий (lgAIN), 82% из 59 низкодифференцированных AIN (hgAIN) и четырех из пяти случаев рака анального канала. Была разработана шкала метилирования, в которой значения увеличиваются по мере роста тяжести заболевания: среднее значение составляло 8,1% в случае доброкачественных, 13,2% в случае lgAIN, 22,3% в случае hgAIN и 49,3% в случае раковых заболеваний. Показатель метилирования в качестве классификатора сортировки при пороговом значении 8,8 давал чувствительность 90,6%, специфичность 50,7% и площадь под кривой 0,82 в случае дифференцирования hgAIN и рака от доброкачественных и lgAIN-биопсий.

Авторы пришли к выводу, что все случаи анального рака показали наличие у пациентов специфических эпигенетических маркеров гена белковых мембран эритроцитов Erythrocyte Membrane Protein Band 4.1 Like 3 (EPB41L3), гена-супрессора опухоли, а также вирусного генома ВПЧ на определенных участках. Аттила Т. Лоренц (Attila T. Lorincz), доктор философии, профессор и ведущий автор исследования, говорит: “Мы считаем, что этот новый набор биомаркеров способен указывать на то, что мужчины и женщины находятся на стадии риска развития анального рака. Теперь, когда мы можем идентифицировать тех, кто находится под угрозой, и тех, кто не подвергается риску, мы надеемся увидеть серьезное усовершенствование, убеждаясь в том, что аноскопия и лазерная или химическая хирургия предоставляются только тем, кто в этом действительно нуждается”. Исследование было опубликовано 18 мая 2017 года в журнале Oncotarget.

Ссылки по теме:
Queen Mary University of London