Генетические мутации связаны с подтипом аутизма
By LabMedica International staff writers
Posted on 13 Aug 2014
Расстройство аутистического спектра (РАС), представляющее собой различные нарушения с выраженной генотипической и фенотипической комплексностью, а также генетическая мутация, определено обуславливающая возникновение аутизма, были рассмотрены в исследовании. Posted on 13 Aug 2014
Идентифицированные ранее генетические события, например ломкость Х-хромосомы, которые обуславливают большее число случаев аутизма, ассоциировались с другими нарушениями функций, такими как умственная отсталость, больше, чем с аутизмом, в то время как у некоторых отмечается аутизм с характерными желудочно-кишечными расстройствами, головой большего размера и широко расположенными глазами.

Система секвенирования HiSeq 2500 (фото любезно предоставлено компанией Illumina).
В рамках совместного проекта, в котором принимали участие 13 организаций со всего мира, было проведено исследование 6176-ти детей с расстройством аутистического спектра. Под руководством ученых из Вашингтонского университета (Сиэтл, штат Вашингтон, США) были собраны образцы крови и выделена геномная ДНК. Инверсия молекулярных зондов была выполнена секвенированием на базе системы HiSeq (Компания Illumina; Сан-Диего, штат Калифорния, США). При сравнительной геномной гибридизации была применена специальная настройка матрицы 8 × 60K (компания Agilent, Санта-Клара, штат Калифорния, США) с пробой 150 пар нуклеотидов, расположенных через промежутки на теле определенного гена, и предсказаны соседние регуляторные частицы.
Ученые обнаружили, что у 15 из 6176 детей с РАС была мутация в гене, кодирующем хромодомен хеликаза ДНК-связывающий белок 8 (CHD8), и во всех этих случаях наблюдались похожие характерные внешние признаки и проблемы с нарушением сна и желудочно-кишечными заболеваниями. Было идентифицировано в общей сложности 15 независимых мутаций, и никаких случаев усечения не было обнаружено у 8792 испытуемых из контрольной группы, включая 2289 непораженных братьев и сестер. В дополнение к высокой вероятности диагноза РАС среди пациентов, являющихся носителями мутации CHD8, к характерным особенностям, расширяющим эту группу, добавлены макроцефалия, отличительные черты лица и заболевания желудочно-кишечного тракта.
Наиболее часто исследуемыми происходящими в геноме событиями, связанными с аутизмом, являются хромосомные перестановки, называемые “вариации числа копий”, в которых часть хромосомы копируется или удаляется, однако ни одна из перестановок не приводила к более чем 1% всех случаев аутизма. Пока фактор числа копий связывают с аутизмом, нет окончательной зависимости, или, как говорят среди ученых, “полной пенетрантности”.
Рафаэль Бернье (Raphael Bernier), доктор философии, преподаватель психиатрии и ведущий автор исследования, сказал: “Мы наконец определили специфический ген в качестве точной причины развития аутизма. Это будет кардинальная перемена на пути изучения аутизма. Несмотря на то, что данный вид аутизма, связанный с мутацией CHD8, будет наблюдаться меньше чем у половины процента всех детей, это исследование имеет большое значение”. Исследование было опубликовано 3 июля 2014 года в журнале “Клетка”.
Ссылки по теме:
University of Washington
Illumina
Agilent