Проанализирован тест на инфекционные заболевания путем секвенирования внеклеточной ДНК

By LabMedica International staff writers
Posted on 06 Feb 2019

Клинические сотрудники, тестирующие анализ на инфекционные заболевания путем секвенирования внеклеточной ДНК, сообщили о промежуточных результатах исследования и неофициальных данных анализа.

Компания Karius (Редвуд-Сити, штат Калифорния, США) разрабатывает технологию выделения внеклеточной патогенной ДНК из крови. В частности, ее технология направлена на выявление причины сепсиса и диагностику инфекции у пациентов с ослабленным иммунитетом.

Тест Karius представляет собой комплексный анализ секвенирования следующего поколения, выполняемый CLIA-сертифицированной и аккредитованной Американской коллегией патологоанатомов лабораторией Karius для выявления и количественного определения микробной внеклеточной ДНК в плазме из более чем 1000 бактерий, ДНК-вирусов, грибов, плесени и простейших (фото любезно предоставлено Karius).

Ученые, работающие с Детской исследовательской больницей Св. Иуды (St. Jude Children's Research Hospital; Мемфис, штат Теннесси, США), изучили пациентов с трудно поддающейся лечению или рецидивирующей острой лимфатической лейкемией (ОЛЛ) или с острым миелобластным лейкозом (ОМЛ). Для пациентов, у которых развилась инфекция кровотока, была проведена стандартная культуральная диагностика, но тест Karius также проводился на любых образцах, которые были доступны в срок до 7 дней до постановки диагноза и до 7 дней после постановки диагноза. Цель состояла в том, чтобы определить, может ли тест Karius определить патоген до того, как диагноз будет поставлен на основании культуры. Тест Karius позволил выявить возбудителя, который в конечном итоге был диагностирован культурой в 9 из 11 случаев. В 10 случаях у ученых также были образцы крови за 3 дня до постановки диагноза, и тест Karius позволил выявить возбудителя в 9 из этих образцов.

Команда проанализировала образцы от 16 пациентов без инфекций, и хотя тест Karius действительно выявил бактерии и грибки в 3 из этих случаев, ни один из данных организмов не был связан с инфекциями кровотока. Доктор медицины Кэтрин Гоггин (Kathryn Goggin), клинический исследователь и старший автор исследования, заявила: "В ряде случаев Karius, помимо возбудителя болезни, идентифицировал другие микробы и сообщил, что эти результаты имеют неясное клиническое значение". Этими случаями, как было отмечено, могут быть полимикробные инфекции, контаминация или даже явление, известное как транслокация кишечных бактерий, когда местные кишечные бактерии проникают в другие ткани и органы и могут привести к инфекции кровотока. Это заболевание чаще встречается у людей с ослабленным иммунитетом.

Исследование было представлено на ежегодной конференции Американского общества инфекционных болезней IDWeek (Infectious Diseases Society of America), проходившей 3-7 октября 2018 года в Сан-Франциско (Калифорния, США).

Ссылки по теме:
Karius
Детская исследовательская больница Св. Иуды