Молекулярный экспресс-тест разработан для выявления энтеровируса D68

Более быстрый лабораторный тест был разработан для обнаружения энтеровируса D68 (EV-D68) в пробах, взятых у людей с заболеванием дыхательных путей.

Каждый год энтеровирусы и риновирусы вызывают миллионы заболеваний дыхательных путей у детей, а в этом году EV-D68 был наиболее распространенным типом выявленного энтеровируса, приводя к увеличениям заболеваний среди детей и наиболее сильно поражая их астмой.


Ученые из Центров по контролю и профилактике заболеваний Соединенных Штатов (CDC; Атланта, штат Джорджия, США) разработали полимеразную цепную реакцию (ПЦР) с обратной транскриптазой в режиме реального времени, которая идентифицирует все штаммы EV-D68, которые наблюдались этим летом. Новый тест имеет меньшее число более коротких этапов, чем тест, который CDC и некоторые штаты Америки использовали при вспышке EV-D68, при этом новый тест позволяет одновременно анализировать большее число образцов.

Центры по контролю и профилактике заболеваний проверили 1163 пробы, предложенные больницами, из 45 штатов Америки. Из проб, проверенных лабораторией CDC с 1 августа 2014 года по 10 октября 2014 года, приблизительно половина дала положительный результат на EV-D68. Приблизительно одна треть дала положительный результат на риновирус или энтеровирус, отличный от EV-D68. Новый лабораторный тест позволит CDC обработать приблизительно тысячу оставшихся проб с гораздо большей скоростью. Наиболее подходящими пробами считаются мазок из носоглотки и/или ротоглоточный мазок, которые дают высокую диагностическую эффективность, или другие дыхательные пробы, такие как смыв из носа или материалы, взятые путем аспирации. Образцы сыворотки имеют ожидаемую низкую эффективность.

Вирусная рибонуклеиновая кислота (РНК) была извлечена с помощью набора QIAamp Viral RNA Mini Kit (компания Qiagen; Валенсия, штат Калифорния, США), а ПЦР с обратной транскриптазой в режиме реального времени была выполнена с помощью комплекта SuperScript III Platinum One Step qRT PCR Kit (корпорация Invitrogen; Карлсбад, штат Калифорния, США) и систем для проведения ПЦР в режиме реального времени AB 7500 Real Time PCR (Applied Biosystems; Фостер-Сити, штат Калифорния, США). Центры по контролю и профилактике заболеваний рассчитывают завершить исследование оставшихся образцов, которые были получены с середины сентября, в течение приблизительно 7 - 10 дней, начиная с исследования 40 образцов в день и доходя до исследования 180 образцов в день. Это позволит им в дальнейшем проводить исследования новых образцов и сообщать о результатах в течение нескольких дней после их получения.

Результат выполнения теста на EV-D68 заключается в сборе изучаемых данных, которые помогут представителям организаций общественного здравоохранения планировать действия в случае вспышки заболевания, а не определять план лечения для конкретного пациента. Чтобы достичь наилучшего понимания болезни, Центры по контролю и профилактике заболеваний уделили основное внимание тестированию самых серьезных случаев с августа 2014 года, когда началась вспышка заболевания.

Ссылки по  теме:
US Centers for Disease Control and Prevention
Qiagen
Invitrogen