用DNA甲基化微阵列量化白细胞亚型

By LabMedica International staff writers
Posted on 10 Apr 2014

一项基于微阵列的新技术用DNA甲基化同时量化多种类型的白细胞，这样能够研究新鲜血样和库存血样里的免疫调控，而库存血样以前不能用于此类分析。

细胞系特有的DNA甲基化模式能区分正常的人白细胞亚型，可用于检测和量化外周血中的这些亚型。然而，现有的所有免疫细胞计数方法都要求用全细胞，“金标准”方法有：人工五分类计数，采用自动五分类和荧光活化细胞分拣器(FACS)的全血计数(CBC)。

图片：一项新技术通过查看标志性的DNA甲基化程度区分血液里的细胞类型。黄色代表无甲基化，蓝色代表全甲基化（图片蒙布朗大学惠赐）。

美国布朗大学(Providence, Rhode Island, USA)的研究人员开发的一种方法用DNA甲基化同时量化多种白细胞，无需计数全细胞。

他们使用Illumina公司(San Diego, CA, USA)的Infinium HumanMethylation和VeraCode GoldenGate甲基化微阵列测定鉴定细胞系特有的DNA甲基化特征，这些特征能鉴别人类的T细胞、B细胞、NK细胞、单细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞和嗜中性粒细胞。然后他们用生物信息学方法在复杂的混合物（包括全血）中量化上述类型的细胞，只在20个CpG（由磷酸二酯键连接的胞嘧啶和鸟嘌呤）基因座上应用DNA甲基化特征。

他们用这一DNA甲基化方法量化80份人类全血样本中的细胞成分，通过直接与作为金标准的免疫量化方法比较验证了其准确性，这些免疫量化方法利用了细胞的物理特征、光学特征和蛋白质组学特征。他们还证明该方法不受血样贮藏的影响，甚至在无法使用金标准方法的条件下也有效。

该研究的论文发表于2014年3月5日的《基因组生物学》(Genome Biology)杂志。资深作者、布朗大学流行病学教授Karl T. Kelsey博士说：“每种细胞都有自己的甲基化特征。一旦理解了固定不变的独特特征，就可以利用它，不再需要用到细胞。”

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