Разработана панель белков для раннего выявления рака легких
By LabMedica International staff writers Posted on 08 Oct 2019 |
Масс-анализатор TripleTOF 6600 Quadrupole Time-Of-Flight (QTOF). Фото любезно предоставлено Sciex.
Рак легких является наиболее распространенной причиной онкологической смертности во всем мире, характеризующейся поздней клинической картиной, поскольку у 49-53% пациентов болезнь диагностируется уже на IV стадии и, следовательно, имеет плохой исход.
Скрининг с использованием низкодозной компьютерной томографии (НДКТ) доказал свою эффективность в снижении смертности от рака легких в группах высокого риска, но все еще существует значительная неоднозначность во мнениях, как наилучшим образом определять эти группы. В настоящее время выводы делаются на основе данных о возрасте и стаже курения, но белок и другие биомаркеры также могут послужить этой цели.
Ученые из Манчестерского университета (Манчестер, Великобритания) проанализировали 50 образцов сыворотки из биобанка Объединенного исследования по скринингу рака яичников в Великобритании (United Kingdom Collaborative Trial of Ovarian Cancer Screening, UKCTOCS), 25 от здоровых участников контрольной группы и 25 от пациентов, у которых был диагностирован рак легких в течение 50 месяцев после взятия крови. Команда использовала кровь, собранную во время хирургической резекции опухолей легких в эксперименте по изобарному мечению iTRAQ, чтобы идентифицировать белки, попадающие из опухолей в легочные вены.
Команда применила метод SWATH (последовательная периодическая регистрация всех теоретических фрагментов) на масс-спектрометре Sciex TripleTOF 6600 для анализа образцов сыворотки. Образцы анализировали с использованием показаний жидкостной хроматографии (ЖХ) каждые два часа, и было идентифицировано 65 белков, которые были дифференциально экспрессированы между двумя группами. С использованием иерархической кластеризации и анализа основных компонентов была определена панель из 11 белков, которые различались в группе пациентов с заболеванием и контрольной группе за год до постановки диагноза с чувствительностью 88% и специфичностью 89%. 12-белковая панель, которая включала маркер, идентифицированный в более ранних исследованиях, была способна различить случаи заболевания и показатели контрольных групп за три года до постановки диагноза с чувствительностью 79% и специфичностью 78%.
Энтони Д. Уиттон (Anthony D. Whetton), доктор философии, профессор и ведущий автор исследования, говорит: “В идеале у нас должен быть тест на основе переносимых кровью биомаркеров для определения риска и стратификации пациентов, чтобы, взглянув на результаты этого теста, можно было определить, требуется ли дальнейшее наблюдение. Я думаю, что это как раз-таки та область исследования, которая очень важна в отношении рака легких”. Исследование было опубликовано 13 августа 2019 года в журнале Journal of Proteome Research.
Ссылки по теме:
University of Manchester
Скрининг с использованием низкодозной компьютерной томографии (НДКТ) доказал свою эффективность в снижении смертности от рака легких в группах высокого риска, но все еще существует значительная неоднозначность во мнениях, как наилучшим образом определять эти группы. В настоящее время выводы делаются на основе данных о возрасте и стаже курения, но белок и другие биомаркеры также могут послужить этой цели.
Ученые из Манчестерского университета (Манчестер, Великобритания) проанализировали 50 образцов сыворотки из биобанка Объединенного исследования по скринингу рака яичников в Великобритании (United Kingdom Collaborative Trial of Ovarian Cancer Screening, UKCTOCS), 25 от здоровых участников контрольной группы и 25 от пациентов, у которых был диагностирован рак легких в течение 50 месяцев после взятия крови. Команда использовала кровь, собранную во время хирургической резекции опухолей легких в эксперименте по изобарному мечению iTRAQ, чтобы идентифицировать белки, попадающие из опухолей в легочные вены.
Команда применила метод SWATH (последовательная периодическая регистрация всех теоретических фрагментов) на масс-спектрометре Sciex TripleTOF 6600 для анализа образцов сыворотки. Образцы анализировали с использованием показаний жидкостной хроматографии (ЖХ) каждые два часа, и было идентифицировано 65 белков, которые были дифференциально экспрессированы между двумя группами. С использованием иерархической кластеризации и анализа основных компонентов была определена панель из 11 белков, которые различались в группе пациентов с заболеванием и контрольной группе за год до постановки диагноза с чувствительностью 88% и специфичностью 89%. 12-белковая панель, которая включала маркер, идентифицированный в более ранних исследованиях, была способна различить случаи заболевания и показатели контрольных групп за три года до постановки диагноза с чувствительностью 79% и специфичностью 78%.
Энтони Д. Уиттон (Anthony D. Whetton), доктор философии, профессор и ведущий автор исследования, говорит: “В идеале у нас должен быть тест на основе переносимых кровью биомаркеров для определения риска и стратификации пациентов, чтобы, взглянув на результаты этого теста, можно было определить, требуется ли дальнейшее наблюдение. Я думаю, что это как раз-таки та область исследования, которая очень важна в отношении рака легких”. Исследование было опубликовано 13 августа 2019 года в журнале Journal of Proteome Research.
Ссылки по теме:
University of Manchester