Персонализированное выявление цоДНК предвосхищает рак молочной железы
By LabMedica International staff writers Posted on 03 May 2019 |
Анализ крови Natera выявляет рецидивы рака молочной железы (фото любезно предоставлено Университетом Лестера).
Рак молочной железы является одним из наиболее часто диагностируемых видов рака во всем мире, это вторая по значимости причина смертности от рака у женщин. В настоящее время стандартом медицинской помощи женщинам с первичным (неметастатическим) раком молочной железы является хирургическое вмешательство, после которого часто следует адъювантная терапия для устранения микроскопической минимальной остаточной болезни (МОБ).
Было показано, что циркулирующая опухолевая ДНК (цоДНК), обнаруживаемая в плазме крови, отражает мутационные признаки первичной опухоли и становится потенциальным неинвазивным биомаркером для мониторинга прогрессирования опухоли при различных типах рака. Тем не менее до 43% пациенток с раком молочной железы не имеют горячих точек мутагенеза и, следовательно, не могут проходить мониторинг с использованием методики драйверного гена.
Многочисленная группа ученых, сотрудничающих с Имперским колледжем Лондона (Лондон, Великобритания), отобрала 49 пациенток с первичным раком молочной железы после проведения им операции и последующей адъювантной терапии. Ученые собирали 208 образцов плазмы каждые шесть месяцев на протяжении четырех лет. Персонализированные анализы, направленные на 16 вариантов, выбранных из данных по всему экзому первичной опухоли, были протестированы в серийной плазме на наличие цоДНК с помощью сверхглубокого секвенирования Signatera (Natera, Сан-Карлос, штат Калифорния, США). Специфические для пациента соматические варианты были идентифицированы путем сравнения парных первичных опухолей и соответствующих профилей полноэкзомного секвенирования ДНК лейкоцитов для всех 49 пациенток.
Исследователи обнаружили цоДНК в плазме крови до клинического или рентгенологического рецидива у 16 из 18 пациенток с рецидивом (чувствительность 89%); метастатический рецидив был предсказан с временем упреждения до двух лет (медиана = 8,9 месяца, диапазон: 0,5-24,0 месяца). Ни одна из 31 пациентки без рецидива не была цоДНК-положительной в любой момент времени в пределах рассмотренных 156 образцов плазмы (специфичность 100%). Из двух пациенток с рецидивом, которые не были выявлены в ходе исследования, у первой имелся только местный рецидив, в то время как у второй пациентки имел место рецидив в кости, и она прошла химиотерапию всего за 13 дней до забора крови.
Авторы пришли к выводу, что им удалось показать, что специфический для пациента анализ цоДНК может быть чувствительным и специфическим подходом для наблюдения за болезнями у пациентов с раком молочной железы. Что еще более важно, раннее выявление (за два года) обеспечивает возможное окно для терапевтического вмешательства. Исследование было опубликовано 16 апреля 2019 года в журнале Clinical Cancer Research.
Ссылки по теме:
Imperial College London
Natera
Было показано, что циркулирующая опухолевая ДНК (цоДНК), обнаруживаемая в плазме крови, отражает мутационные признаки первичной опухоли и становится потенциальным неинвазивным биомаркером для мониторинга прогрессирования опухоли при различных типах рака. Тем не менее до 43% пациенток с раком молочной железы не имеют горячих точек мутагенеза и, следовательно, не могут проходить мониторинг с использованием методики драйверного гена.
Многочисленная группа ученых, сотрудничающих с Имперским колледжем Лондона (Лондон, Великобритания), отобрала 49 пациенток с первичным раком молочной железы после проведения им операции и последующей адъювантной терапии. Ученые собирали 208 образцов плазмы каждые шесть месяцев на протяжении четырех лет. Персонализированные анализы, направленные на 16 вариантов, выбранных из данных по всему экзому первичной опухоли, были протестированы в серийной плазме на наличие цоДНК с помощью сверхглубокого секвенирования Signatera (Natera, Сан-Карлос, штат Калифорния, США). Специфические для пациента соматические варианты были идентифицированы путем сравнения парных первичных опухолей и соответствующих профилей полноэкзомного секвенирования ДНК лейкоцитов для всех 49 пациенток.
Исследователи обнаружили цоДНК в плазме крови до клинического или рентгенологического рецидива у 16 из 18 пациенток с рецидивом (чувствительность 89%); метастатический рецидив был предсказан с временем упреждения до двух лет (медиана = 8,9 месяца, диапазон: 0,5-24,0 месяца). Ни одна из 31 пациентки без рецидива не была цоДНК-положительной в любой момент времени в пределах рассмотренных 156 образцов плазмы (специфичность 100%). Из двух пациенток с рецидивом, которые не были выявлены в ходе исследования, у первой имелся только местный рецидив, в то время как у второй пациентки имел место рецидив в кости, и она прошла химиотерапию всего за 13 дней до забора крови.
Авторы пришли к выводу, что им удалось показать, что специфический для пациента анализ цоДНК может быть чувствительным и специфическим подходом для наблюдения за болезнями у пациентов с раком молочной железы. Что еще более важно, раннее выявление (за два года) обеспечивает возможное окно для терапевтического вмешательства. Исследование было опубликовано 16 апреля 2019 года в журнале Clinical Cancer Research.
Ссылки по теме:
Imperial College London
Natera