Проанализирован тест на инфекционные заболевания путем секвенирования внеклеточной ДНК
By LabMedica International staff writers Posted on 06 Feb 2019 |
Тест Karius представляет собой комплексный анализ секвенирования следующего поколения, выполняемый CLIA-сертифицированной и аккредитованной Американской коллегией патологоанатомов лабораторией Karius для выявления и количественного определения микробной внеклеточной ДНК в плазме из более чем 1000 бактерий, ДНК-вирусов, грибов, плесени и простейших (фото любезно предоставлено Karius).
Клинические сотрудники, тестирующие анализ на инфекционные заболевания путем секвенирования внеклеточной ДНК, сообщили о промежуточных результатах исследования и неофициальных данных анализа.
Компания Karius (Редвуд-Сити, штат Калифорния, США) разрабатывает технологию выделения внеклеточной патогенной ДНК из крови. В частности, ее технология направлена на выявление причины сепсиса и диагностику инфекции у пациентов с ослабленным иммунитетом.
Ученые, работающие с Детской исследовательской больницей Св. Иуды (St. Jude Children's Research Hospital; Мемфис, штат Теннесси, США), изучили пациентов с трудно поддающейся лечению или рецидивирующей острой лимфатической лейкемией (ОЛЛ) или с острым миелобластным лейкозом (ОМЛ). Для пациентов, у которых развилась инфекция кровотока, была проведена стандартная культуральная диагностика, но тест Karius также проводился на любых образцах, которые были доступны в срок до 7 дней до постановки диагноза и до 7 дней после постановки диагноза. Цель состояла в том, чтобы определить, может ли тест Karius определить патоген до того, как диагноз будет поставлен на основании культуры. Тест Karius позволил выявить возбудителя, который в конечном итоге был диагностирован культурой в 9 из 11 случаев. В 10 случаях у ученых также были образцы крови за 3 дня до постановки диагноза, и тест Karius позволил выявить возбудителя в 9 из этих образцов.
Команда проанализировала образцы от 16 пациентов без инфекций, и хотя тест Karius действительно выявил бактерии и грибки в 3 из этих случаев, ни один из данных организмов не был связан с инфекциями кровотока. Доктор медицины Кэтрин Гоггин (Kathryn Goggin), клинический исследователь и старший автор исследования, заявила: "В ряде случаев Karius, помимо возбудителя болезни, идентифицировал другие микробы и сообщил, что эти результаты имеют неясное клиническое значение". Этими случаями, как было отмечено, могут быть полимикробные инфекции, контаминация или даже явление, известное как транслокация кишечных бактерий, когда местные кишечные бактерии проникают в другие ткани и органы и могут привести к инфекции кровотока. Это заболевание чаще встречается у людей с ослабленным иммунитетом.
Исследование было представлено на ежегодной конференции Американского общества инфекционных болезней IDWeek (Infectious Diseases Society of America), проходившей 3-7 октября 2018 года в Сан-Франциско (Калифорния, США).
Ссылки по теме:
Karius
Детская исследовательская больница Св. Иуды
Компания Karius (Редвуд-Сити, штат Калифорния, США) разрабатывает технологию выделения внеклеточной патогенной ДНК из крови. В частности, ее технология направлена на выявление причины сепсиса и диагностику инфекции у пациентов с ослабленным иммунитетом.
Ученые, работающие с Детской исследовательской больницей Св. Иуды (St. Jude Children's Research Hospital; Мемфис, штат Теннесси, США), изучили пациентов с трудно поддающейся лечению или рецидивирующей острой лимфатической лейкемией (ОЛЛ) или с острым миелобластным лейкозом (ОМЛ). Для пациентов, у которых развилась инфекция кровотока, была проведена стандартная культуральная диагностика, но тест Karius также проводился на любых образцах, которые были доступны в срок до 7 дней до постановки диагноза и до 7 дней после постановки диагноза. Цель состояла в том, чтобы определить, может ли тест Karius определить патоген до того, как диагноз будет поставлен на основании культуры. Тест Karius позволил выявить возбудителя, который в конечном итоге был диагностирован культурой в 9 из 11 случаев. В 10 случаях у ученых также были образцы крови за 3 дня до постановки диагноза, и тест Karius позволил выявить возбудителя в 9 из этих образцов.
Команда проанализировала образцы от 16 пациентов без инфекций, и хотя тест Karius действительно выявил бактерии и грибки в 3 из этих случаев, ни один из данных организмов не был связан с инфекциями кровотока. Доктор медицины Кэтрин Гоггин (Kathryn Goggin), клинический исследователь и старший автор исследования, заявила: "В ряде случаев Karius, помимо возбудителя болезни, идентифицировал другие микробы и сообщил, что эти результаты имеют неясное клиническое значение". Этими случаями, как было отмечено, могут быть полимикробные инфекции, контаминация или даже явление, известное как транслокация кишечных бактерий, когда местные кишечные бактерии проникают в другие ткани и органы и могут привести к инфекции кровотока. Это заболевание чаще встречается у людей с ослабленным иммунитетом.
Исследование было представлено на ежегодной конференции Американского общества инфекционных болезней IDWeek (Infectious Diseases Society of America), проходившей 3-7 октября 2018 года в Сан-Франциско (Калифорния, США).
Ссылки по теме:
Karius
Детская исследовательская больница Св. Иуды