Анализ полипов носовой полости позволяет сделать предположение о механизмах воспаления
By LabMedica International staff writers Posted on 08 Oct 2018 |
Принцип действия недорогой платформы Seq-Well для секвенирования РНК одиночных клеток (фото любезно предоставлено Shalek Lab).
Аллергическое воспаление может развиваться от устойчивой активации иммунитета 2-го типа в верхних дыхательных путях, что приводит к хроническому риносинуситу, который по тяжести варьируется от ринита до более серьезных полипов носовой полости.
Гиперплазия базальных клеток является отличительной чертой тяжелой болезни, но неизвестно, как эти клетки-предшественники способствуют клиническому проявлению и нарушению барьерной ткани человека. В попытке выяснить молекулярные механизмы хронических воспалительных заболеваний ученые профилировали транскриптомы полипов носовой полости и носовые складки секвенированием РНК одиночных клеток.
Ученые из Женской больницы Бригама (Brigham and Women's Hospital; Бостон, штат Массачусетс, США) и их коллеги выполнили секвенирование РНК одиночных клеток на более чем 18 000 клеток из 12 хирургически удаленных полипов носовой полости, охватывающих целый спектр заболеваний. Они использовали Seq-Well для массового параллельного секвенирования РНК одиночных клеток, представили транскриптомы для респираторных эпителиальных, иммунных и стромальных типов клеток человека и подмножеств воспалительного заболевания типа 2 и отметили ключевые медиаторы. Seq-Well - недорогая переносная платформа для секвенирования РНК одиночных клеток, предназначенная для совмещенной работы с недорогими клиническими биопсиями.
Исследователи обнаружили, что разнообразие типов эпителиальных клеток было уменьшено в носовых полипах, которые содержали несколько железистых и реснитчатых клеток и были обогащены базальными клетками. У последних, по всей видимости, недоставало способности дифференцироваться в другие типы клеток. Это уменьшение клеточного разнообразия может быть объяснено различиями в экспрессии генов, обнаруженными учеными между полипными и неполипными базальными клетками-предшественниками. Кроме того, было показано, что транскрипционная программа, активированная цитокинами IL-4 и IL-13, сильно индуцируется в базальных клетках-предшественниках из полипов, что предполагает возможное лечение антителом, которое блокирует субъединицу рецептора IL-4/IL-13.
Авторы пришли к выводу, что снижение эпителиального разнообразия, вызванное функциональными сдвигами в базальных клетках, является ключевой характеристикой иммуноопосредованной дисфункции барьерной ткани типа 2. Их результаты показывают, что эпителиальные стволовые клетки могут способствовать сохранению человеческой болезни, выступая в качестве хранилищ для аллергических воспоминаний. Исследование было опубликовано 22 августа 2018 года в журнале Nature.
Ссылки по теме:
Женская больница Бригама
Гиперплазия базальных клеток является отличительной чертой тяжелой болезни, но неизвестно, как эти клетки-предшественники способствуют клиническому проявлению и нарушению барьерной ткани человека. В попытке выяснить молекулярные механизмы хронических воспалительных заболеваний ученые профилировали транскриптомы полипов носовой полости и носовые складки секвенированием РНК одиночных клеток.
Ученые из Женской больницы Бригама (Brigham and Women's Hospital; Бостон, штат Массачусетс, США) и их коллеги выполнили секвенирование РНК одиночных клеток на более чем 18 000 клеток из 12 хирургически удаленных полипов носовой полости, охватывающих целый спектр заболеваний. Они использовали Seq-Well для массового параллельного секвенирования РНК одиночных клеток, представили транскриптомы для респираторных эпителиальных, иммунных и стромальных типов клеток человека и подмножеств воспалительного заболевания типа 2 и отметили ключевые медиаторы. Seq-Well - недорогая переносная платформа для секвенирования РНК одиночных клеток, предназначенная для совмещенной работы с недорогими клиническими биопсиями.
Исследователи обнаружили, что разнообразие типов эпителиальных клеток было уменьшено в носовых полипах, которые содержали несколько железистых и реснитчатых клеток и были обогащены базальными клетками. У последних, по всей видимости, недоставало способности дифференцироваться в другие типы клеток. Это уменьшение клеточного разнообразия может быть объяснено различиями в экспрессии генов, обнаруженными учеными между полипными и неполипными базальными клетками-предшественниками. Кроме того, было показано, что транскрипционная программа, активированная цитокинами IL-4 и IL-13, сильно индуцируется в базальных клетках-предшественниках из полипов, что предполагает возможное лечение антителом, которое блокирует субъединицу рецептора IL-4/IL-13.
Авторы пришли к выводу, что снижение эпителиального разнообразия, вызванное функциональными сдвигами в базальных клетках, является ключевой характеристикой иммуноопосредованной дисфункции барьерной ткани типа 2. Их результаты показывают, что эпителиальные стволовые клетки могут способствовать сохранению человеческой болезни, выступая в качестве хранилищ для аллергических воспоминаний. Исследование было опубликовано 22 августа 2018 года в журнале Nature.
Ссылки по теме:
Женская больница Бригама