Разработан точный инструмент для отслеживания новых случаев ВИЧ-инфекции
By LabMedica International staff writers Posted on 26 Apr 2018 |
Bio-Plex 200 представляет собой флуоресцентный считыватель для многоканального анализа суспензии, используемый для анализов, позволяющий измерять до 100 биомолекул белка или нуклеиновой кислоты в одном образце (фото любезно предоставлено Bio-Rad Laboratories).
В настоящее время предпринимаются усилия по разработке более точного способа оценки распространенности инфекций вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) в больших популяциях, что позволит улучшить стратегии профилактики и проведение научных исследований во всем мире.
Точная оценка заболеваемости ВИЧ-1 имеет решающее значение для успеха стратегий профилактики ВИЧ-1. Используемые в настоящее время анализы ограничены высокими ложными недавними показателями (ЛНП) в некоторых популяциях и короткой средней продолжительностью недавнего инфицирования (СПНИ).
Многочисленная группа ученых, при совместном сотрудничестве с Медицинским центром Университета Дьюка (Duke University Medical Center; Дарем, штат Северная Каролина, США), получила для тестирования 132 хорошо охарактеризованных экземпляра, взятых до лечения в течение 800 дней с предполагаемой даты сероконверсии (120 уникальных участников), для оценки СПНИ, а также 134 образца (121 участник) до лечения и 58 образцов (56 участника) после лечения многолетней инфекции для оценки ЛНП. Образцы были взяты в основном от участников, инфицированных подтипами B (56%) и C (43%).
Исследователи профилировали ответы ВИЧ-1-специфического связывающего антитела в сыворотке или плазме участника. Было оценено связывание антител с уникальным и широким набором антигенов ВИЧ-1, которые включали антигены gp120, gp140 и V1-V2 из нескольких подтипов (то есть A, CRF01-AE, B, C и CRF07-BC) у обоих полов. Сыворотка и плазма разбавлялись в многоканальном анализе связывания антител, детектирование выполнялось на аппаратах Bioplex 200 или Luminex FM3D.
Ученые обнаружили, что дискриминантный анализ выявил оптимальный набор измерений, которые впоследствии были оценены на панели проверки достоверности биомаркеров с 324 образцами. Эти биомаркеры включали в себя кладу C gp140 IgG3, авидность клад C gp140 IgG4, авидность клад B gp140 IgG4 и авидность IgG области антигенной детерминанты gp41. СПНИ оценивали через 215 дней или альтернативно через 267 дней. Показатели ЛНП у нелеченных и леченых участников составили 5,0% и 3,6% соответственно.
Доктор философии Джорджия Томарас (Georgia Tomaras), профессор кафедры хирургии и старший автор исследования, сказала: "Недавние достижения, в том числе эффективные антиретровирусные препараты, которые как лечат, так и предотвращают ВИЧ-инфекции, изменили ландшафт в области ВИЧ. Совершенствование методов классификации недавних инфекций от более старых инфекций крайне необходимо для определения наиболее эффективных стратегий профилактики. Наличие более точного теста на заболеваемость ВИЧ может существенно снизить затраты для ученых, поскольку для регистрации в исследованиях потребуется гораздо меньший размер выборки". Исследование было опубликовано 21 декабря 2017 года в журнале JCI Insight.
Ссылки по теме:
Медицинский центр Университета Дьюка
Точная оценка заболеваемости ВИЧ-1 имеет решающее значение для успеха стратегий профилактики ВИЧ-1. Используемые в настоящее время анализы ограничены высокими ложными недавними показателями (ЛНП) в некоторых популяциях и короткой средней продолжительностью недавнего инфицирования (СПНИ).
Многочисленная группа ученых, при совместном сотрудничестве с Медицинским центром Университета Дьюка (Duke University Medical Center; Дарем, штат Северная Каролина, США), получила для тестирования 132 хорошо охарактеризованных экземпляра, взятых до лечения в течение 800 дней с предполагаемой даты сероконверсии (120 уникальных участников), для оценки СПНИ, а также 134 образца (121 участник) до лечения и 58 образцов (56 участника) после лечения многолетней инфекции для оценки ЛНП. Образцы были взяты в основном от участников, инфицированных подтипами B (56%) и C (43%).
Исследователи профилировали ответы ВИЧ-1-специфического связывающего антитела в сыворотке или плазме участника. Было оценено связывание антител с уникальным и широким набором антигенов ВИЧ-1, которые включали антигены gp120, gp140 и V1-V2 из нескольких подтипов (то есть A, CRF01-AE, B, C и CRF07-BC) у обоих полов. Сыворотка и плазма разбавлялись в многоканальном анализе связывания антител, детектирование выполнялось на аппаратах Bioplex 200 или Luminex FM3D.
Ученые обнаружили, что дискриминантный анализ выявил оптимальный набор измерений, которые впоследствии были оценены на панели проверки достоверности биомаркеров с 324 образцами. Эти биомаркеры включали в себя кладу C gp140 IgG3, авидность клад C gp140 IgG4, авидность клад B gp140 IgG4 и авидность IgG области антигенной детерминанты gp41. СПНИ оценивали через 215 дней или альтернативно через 267 дней. Показатели ЛНП у нелеченных и леченых участников составили 5,0% и 3,6% соответственно.
Доктор философии Джорджия Томарас (Georgia Tomaras), профессор кафедры хирургии и старший автор исследования, сказала: "Недавние достижения, в том числе эффективные антиретровирусные препараты, которые как лечат, так и предотвращают ВИЧ-инфекции, изменили ландшафт в области ВИЧ. Совершенствование методов классификации недавних инфекций от более старых инфекций крайне необходимо для определения наиболее эффективных стратегий профилактики. Наличие более точного теста на заболеваемость ВИЧ может существенно снизить затраты для ученых, поскольку для регистрации в исследованиях потребуется гораздо меньший размер выборки". Исследование было опубликовано 21 декабря 2017 года в журнале JCI Insight.
Ссылки по теме:
Медицинский центр Университета Дьюка